Bộ máy quản lý Công ty gồm:

- Hội đồng thành viên công ty: 05 người;

- Kiểm soát viên: 01 người;

- VCQL: 04 người (Giám đốc, 02 phó Giám đốc, Phụ trách kế toán).

- Các phòng chức năng: Văn phòng, Phòng Kinh tế, Phòng KT-QLBVR.

- Các Xí nghiệp trực thuộc: 02 Xí nghiệp Lâm nghiệp (Gung Ré, BắcSơn), Xí nghiệp Chế biến lâm sản, Xí nghiệp sản xuất – thương mại – Dịch vụ.

Cơ chế hoạt động của Công ty như sau:

 Công ty hoạt động theo hệ thống cơ cấu tổ chức trực tuyến – chức năng. Các đơn vị trực thuộc gồm 04 Xí nghiệp và 03 phòng nghiệp vụ:

+  02 Xí nghiệp Lâm nghiệp: XNLN Gung Ré quản lý địa bàn xã Gung Ré và một phần xã Liên Đầm; XNLN Bắc Sơn quản lý địa bàn 02 xã Gia Bắc, Sơn Điền. Mỗi Xí nghiệp được bố trí 01 Giám đốc, 01 Phó Giám đốc, 02 đội trưởng và 02 đội phó, một số nhân viên QLBVR, lái xe phục vụ công tác QLBVR và sản xuất. Nhiệm vụ của Xí nghiệp Lâm nghiệp là thực hiện công tác quản lý bảo vệ rừng và chỉ đạo sản xuất trong  phạm vi Xí nghiệp.

+ Xí nghiệp Chế biến Lâm sản: tại xã Gung Ré gồm 02 phân xưởng: Phân xưởng Sơ chế, Phân xưởng tinh chế. Nhiệm vụ chế biến gỗ phục vụ công nghiệp và dân dụng, phôi gỗ xẻ và ván ghép thanh.

+ Xí nghiệp Sản xuất – Thương mại – Dịch vụ: Nhiệm vụ khai thác, vận chuyển lâm sản, sản xuất cây giống, vật tư nông, lâm nghiệp, kinh doanh xăng dầu, du lịch sinh thái…

- Các phòng ban chức năng tham mưu: Văn phòng Công ty, Phòng kỹ thuật -QLBVR, Phòng Kinh tế.